基因组和表观遗传变化往往能促使肿瘤的发生，如：原癌基因的激活和肿瘤抑制基因（Tumor Suppressor Genes，TSGs）的缺失。通过对不同肿瘤中基因拷贝数、甲基化以及突变簇的研究，已经可以将这些突变进行归类。但是，如何分辨良性肿瘤和致病肿瘤仍然充满挑战。虽然通过对拷贝数突变的研究已经发现了潜在的癌基因，但对TSG的识别仍然难以捉摸。首先，肿瘤抑制基因的失活能够通过多个机制来实现，如缺失、沉默、突变，最终导致低频失活。一个已知TSG（>10%的机率）的高频失活是罕见的。此外，既定基因的缺失区域往往难以识别，因为该区域很大，且包含许多基因。最后，TSG单个等位基因的缺失可能会促使肿瘤的发生。

    哈佛大学医学院遗传学组的Nicole L. Solimini等人通过RNAi筛选，发现了成百上千个肿瘤发生或增殖抑制（suppressors of tumorigenesis and/or proliferation，STOP）基因，制约着正常细胞的增殖。磷酸酶和肌动蛋白调节子4（PHACTR4）便是其中之一。Phactr4是Phactr家族中的四个成员之一。研究人员发现，Phactr4能够抑制正常细胞的增殖和转化。Phactr4的缺失能够促进增殖和克隆的形成。Phactr4在一定程度上通过Rb信号通路发挥作用。对肿瘤拷贝数的分析和测序表明，PHACTR4在很多肿瘤亚型中缺失或突变。此外，那些Phactr4表达降低的肿瘤在补充Phactr4后表现出肿瘤抑制，从而导致肿瘤增殖／转化和形成的降低。因此，Phactr4是一个肿瘤抑制子，并且在一些肿瘤中缺失或突变。（作者：贺利军)

参考文献：《Proceedings of the National Academy of Sciences》2013; E407-E414