转座子(transposable elements, TEs)主要通过RNA介导的机制来整合新的拷贝序列进入哺乳动物基因组中。虽然固定人群中的大部分TEs残留是不具有活性的，一些新生的TEs却与许多基因组中的机构性变异有关。体细胞组织中的TE活性往往是通过表观遗传学或者转录后修饰机制被抑制，但一些TEs能够逃避这种抑制，并在干细胞或者早期胚胎发育过程中产生新的多肽插入序列。有一些这种插入序列会在生命后期产生，并导致一些致病基因变异。虽然这些TEs的诱变性已经明确，这些变异逆转录座子究竟在各组织中对肿瘤发病具有何种程度的影响，仍然不甚清楚。

    在癌症中，抑制TE活动度的细胞机制受到破坏，从而促进了变异逆转录转座子的发生。最近，哈佛医学院的Eunjung Lee等研究人员利用单核苷酸分辨率分析法鉴定了TEs整合的位点，揭示了整合机制，并将逆转录座子与其他肿瘤基因组中常见的基因重排进行了区分。

    他们在5种不同的癌症中研究了43个高覆盖率的全基因组序列数据集中TE插入序列情况。结果发现了194个高可信度TE插入序列，以及与之相应的正常基因组中，数千个多态性TE插入序列。体细胞插入序列存在于上皮肿瘤中而非血液或脑部肿瘤中。体细胞L1插入序列通常发生在肿瘤突变基因中，破坏靶基因的表达，且偏爱出现于癌症特异性DNA低甲基化的区域。

    这些现象表明，体细胞L1插入序列在肿瘤发生过程中具有潜在的重要影响。（作者：沈颖)

参考文献：《Sciencexpress》2012;10.1126