英国伯明翰大学的Joshua Quick等人设计了一种埃博拉病毒实时基因组测序监控系统，在2015年4月作为标准航空行李运输至几内亚监测当地疫情，测序过程仅耗时15分钟～60分钟，24小时内出报告，有潜力推广至资源紧缺的疫区实现疫情快速监控。

西非的埃博拉流行已造成28599人感染、11299人死亡，打破历史记录。在疫情暴发时对病毒进行基因组测序有助于把握传染源特征，确定病毒进化速率，认识感染者的表现，找到诊断靶点，筛选合适的疫苗和治疗方案。但由于疫区条件有限，地处偏远，基因组监控只能零零星星地进行。

为了解决这个困难，研究者利用最新的纳米孔DNA测序技术设计出了一个便携式基因监控系统。该系统包括三个重量不足100g的基因组测序仪MinION、四台笔记本电脑、一台热循环仪、一个加热模块（heat block）、一些移液管和其他试剂、耗材等，总重量不到50kg，可以打包成标准行李接受空运。

首先，研究者拿以前的Makona病毒样本检验了监控系统的工作性能，检测结果体现出良好的准确性和一致性。随后，研究者与几内亚的诊断实验室合作，向几内亚官方和世界卫生组织实时报告埃博拉病毒基因组测序结果。在半年内，研究者共检测了142例标本，报告的基因型广泛覆盖了当地的埃博拉病例。结合其他研究检测的603例标本，研究者估算出埃博拉病毒基因组的替换率为1.19×10-3。前十天的实时测序结果提示，引起几内亚疫情的主要是GN1和SL3两型埃博拉病毒。GN1型最早出现在几内亚，塞拉利昂很少，提示该型病毒主要在几内亚流行。SL3型最早出现在塞拉利昂，后来传播到了几内亚首都。两型病毒都于2015年初在塞拉利昂出现过，说明它们在两国之间传播。（作者：包丽霞）

参考文献：Nature 2016;530: 228-232