人类微生物组计划（Human Microbiome Project, HMP）是人类基因组计划的延伸，它研究的重点是通过元基因组学的方法研究人体内及体表的微生物群落与人体健康的关系。2005年10月，HMP第一次协调会议召开，中国、法国、美国、巴西、德国、英国、日本等国的代表共同参加。2006年，中国与法国启动了“中法人体肠道元基因组”合作计划。2007年底，美国国立卫生研究院宣布将投入1亿1500万美元正式启动 “人类微生物组计划”。人类微生物组计划将使用新一代DNA测序仪进行人类微生物组DNA的测序工作，是人类基因组计划完成之后的一项规模更大的DNA测序计划，目标是通过绘制人体不同器官中的微生物元基因组图谱，解析微生物群落结构变化对人类健康的影响。

HMP国际团队已经报道了300名健康成人18个身体部位微生物组的结构，再加上额外12～18个月婴儿的数据，密歇根大学微生物与免疫学部的Tao Ding和Patrick D. Schloss等人运用狄利克雷多项混合模型将每个身体部位的菌群类型进行了分离，并发现了三大特点。第一，在身体的某些部位，菌群类型与幼儿期是否吃早饭、性别以及受教育水平有很大关系。第二，虽然口腔和胃部的菌群在分类学上不同，但这些位点中的微生物可以被相互预测。最后，在取样的过程中，口腔内的菌群是最不稳定的，而胃部和阴道部位的最稳定。这些结果证明，虽然人类微生物组在个体间存在很大差异，但这种差异可以被微生物种群所提示，并且能够反映个体生命历程的特征。理解菌群的多样性以及导致个体所含菌群具有特异性的机制，这将使我们能够通过每个个体的菌群类型来评估其疾病风险，并采取个性化治疗。（作者：贺利军）

参考文献：《Nature》2014;509:357-360