医学进展
2010年2月号
医学进展

酶蛋白设计领域的突破性论文遭质疑

    美国杜克大学医学中心蛋白生化学家Homme Hellinga在蛋白质工程领域非常有名,他领导的研究小组用名为DEZYMER的计算机程序在电脑上对蛋白质的结构进行重组,从理论上使蛋白质变成具有酶活性的生物酵素,随后研究小组在实验室里将一种没有催化活性的核糖体结合蛋白(ribose-binding protein,RBP)进行改造,使之成为具有高度酶活性的生物酵素,该论文发表在《科学》《分子生物学》等杂志上,可以说这是蛋白质工程方面的一项突破性成就。

    论文发表后引起了整个蛋白质工程领域的关注。2008年,纽约州立大学的生化学家John Richard对该研究产生极大兴趣,Richard和另外二名研究人员用时七个月、花费几万美元多次重复这个实验,却没有做出相同的实验结果。Richard发现这项实验做出的核糖体结合蛋白并不具有活性,这种活性其实来自一种混在核糖体结合蛋白中的受污染的杂质。实验在科学程序上并没有错,错误在于Hellinga的实验室没有适当纯化这些蛋白质,然后将杂质的活性当成了蛋白质的活性。

    Richard将自己的实验结果告知Hellinga以及《科学》与《分子生物学》杂志的编辑。Hellinga表示他同意Richard指出的论文中的错误,由于未对设计的酶的活性作进一步观察,因此导致了错误的结果。随后,Hellinga写信给这两个杂志社要求撤回这篇论文。

    近期,德国生物学家Birte Höker又对Hellinga2003年发表在《自然》和2004年发表在《美国科学院院报》的2篇论文产生了新的疑问,这2篇论文也是关于核糖体结合蛋白改造成具有高度的酶活性的生物酵素的。按照Hellinga的实验,Höker重新设计了5种不同结构的核糖体结合蛋白,结果发现这些蛋白都非常不稳定,其中1种蛋白的化学性质不稳定到无法进行实验,Birte Höker对Hellinga论文中的核糖体结合蛋白的稳定性产生质疑。Hellinga表示,Höker进行实验的是核糖体结合蛋白的浓缩物,而不是他原来进行实验时的蛋白,关于核糖体结合蛋白的稳定性他已在论文中表述。

    据悉,美国杜克大学医学中心已对Hellinga的学术不端行为开始展开调查。(编译:宫健)

参考文献:《Nature》2009;461:859

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