RNA病毒具有广泛感染宿主的能力，并具有巨大的遗传和表型多样性。由于它们对公共卫生和农业工业的潜在影响，人们对描述脊椎动物相关RNA病毒的多样性和进化方面相当关注。但人们对其理解主要局限于在哺乳动物和鸟类宿主中发现的，并与显性疾病有关的RNA病毒。

中国疾病预防控制中心传染病预防控制所张永振研究团队使用大规模的Meta转录组方法开展了一项研究，在爬行动物、两栖动物、肺鱼、辐鳍鱼、软骨鱼和无颚鱼中发现了214种与脊椎动物相关的RNA病毒。新发现的病毒出现在与脊椎动物感染相关的RNA病毒的每一个家族或属中，包括了含有人类致病性的病毒，如流感病毒、沙粒病毒和丝状病毒家族，它们的分支顺序广泛反映了其宿主的系统发育史。该研究为大多数脊椎动物RNA病毒建立了长期的进化史，并使用直系同源内源病毒元件来评估进化时间尺度（evolutionary timescales）。该研究还鉴定出了新的脊椎动物特有的RNA病毒及其基因组结构，并重新评估了媒传RNA病毒（vector-borne RNA viruses）的进化。

尽管快速进化和频繁交换宿主两个因素交叉在一起，但研究人员成功对先前未充分采样的宿主的病毒多样性进行了大规模的分析，并表明脊椎动物中的RNA病毒倾向于广泛地遵循它们宿主的进化史，这些宿主从海洋开始，并延续了数亿年。这些结果适用于大多数脊椎动物RNA病毒科或属，与最近使用古病毒学数据对病毒进化进行分析的结果一致。这些结果也对人们理解病毒进化有更广泛的意义。总之，这项研究揭示了每一个与脊椎动物相关的病毒家族的长期的病毒-宿主关系，进一步说明了RNA病毒的古老历史。（作者：侯文辉)

参考文献：Nature 2018;556:197-202