医学进展
2016年11月号
卷首语
医学进展

NCI发布癌症病人数据库

作者:曹喜华

基因组数据共享计划(Genomic Data Commons,GDC)的使命是为癌症研究团体提供一个统一的数据库,通过癌症基因研究使其数据共享以支持精准医学。

GDC从国家癌症研究所(National Cancer Institute,NCI)研究项目入手,比如,癌症基因特征描述以及癌症基因图谱,这些数据都储存在GDC系统中。在不久的将来,NCI临床试验数据也将会存储在该数据库中。欢迎来自世界各地的癌症研究人员将他们的基因组数据和相关的临床数据分享在GDC。使用统一的数据系统促进科研人员与临床医师之间实现数据的共享。GDC有大量的信息存储量,既包含生殖系基因数据也包含体细胞基因数据。所有的数据经过标准化的处理后,供研究人员免费获取。GDC的门户将允许用户使用基于web的工具搜索和下载数据集进行分析。

GDC上最初的读者是研究人员,他们将分析数据作为各种研究项目的一部分,包括理解基因组生物标志物和剖面图、治疗和临床结果的关系。GDC首席研究员罗伯特格罗斯曼(芝加哥大学的医学博士、教授)在邮件中写到:“NCI基因组数据共享是一种基础资源,利用这些基础资源, 精准医学的研究方法在这里可以被挖掘,得以证实验证并提高其临床诊断结果。随着时间的推移,GDC将集中大量最新NCI项目临床试验中病人DNA的测序数据,更多的研究项目和临床试验数据等增加进来后,它会变得更加强大。” GDC是由芝加哥大学的数据密集型科学中心与安大略癌症研究所合作构建和管理并投入运营的数据存储库。(作者:曹喜华)

参考文献:Journal of the American Medical Association 2016; 316:384

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