医学进展
2016年11月号
卷首语
医学进展

破解生命密码,掌握基因奥秘——560个乳腺癌的全基因组测序

作者:包丽霞

英国剑桥桑格研究院的Nik-Zainal等研究人员对560个乳腺癌全基因组序列进行了分析,发现了一些癌症发生的相关基因奥秘,对癌症治疗方法的改进有着重要作用。

癌症突变理论提示癌细胞的DNA序列发生了改变,称之为驱动突变,赋予细胞增殖优势,导致肿瘤的发生。有一些突变来自于种系遗传,更多的突变发生在体细胞。体细胞突变中有许多是和癌症进展无关的“过客”突变。导致突变的多种途径包括:暴露于外源性或内源性致突变物、异常的DNA编辑、DNA复制错误、DNA修复缺陷。过去的50年里,多轮技术进步促使我们描绘出了癌症基因组的突变特征。

本研究中,研究人员对560例乳腺癌进行了全基因组分析,发现了可能携带癌症驱动性突变的93个编码蛋白的癌基因。一些非编码区域表现出高突变率,但是这些非编码区并不包含驱动癌症发生的突变。

研究人员将基因突变的特征分析扩展到基因组重排,从而发现了12个碱基置换和6个重排信号。3个以串联重复或者缺失为特点的重排特征与基于同源重组的 DNA 修复缺陷相关。上述重排情况都和BRCA1或BRCA2功能缺失以及未知的DNA修复缺陷有关。

这项史上最大规模的乳腺癌测序研究包括了外显子、内含子和基因间区域的测序,揭示了乳腺癌基因图谱和突变特征,这些突变对于了解癌症的原因及开发改良疗法至关重要。今后仍需要对非编码区的癌症驱动子进行进一步研究,分析癌症基因库或其他微生物对癌症的作用,从而更好地理解乳腺癌发生的基础——体细胞突变。(作者:包丽霞)

参考文献:Nature 2016;534:47-54

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