肿瘤学的一大挑战是如何杀死那些含有异质细胞群（各细胞群具有不同的基因突变组合）的肿瘤。确认这些突变基因及理解这些基因的相互作用方式，需要进行单细胞分析。但目前的单细胞分析方法（如基于PCR的策略或全外显子测序）都存在某些缺点，如缺乏测序深度或成本过高。SB（sleeping beauty）插入突变在动物模型中用于发现癌症基因。SB转座子系统能够识别早期癌症进展的驱动因子和癌症转移的潜在驱动因子，提供了当前测序技术和有限患者样本不易获得的人类癌症相关信息。
美国休斯顿卫理公会医院研究所的Karen M Mann等人报道了一种液相、基于捕获的测序和生物信息学平台，即SB捕获杂交测序（SB capture hybridization sequencing，SBCapSeq），可在髓系白血病（myeloid leukemia，ML）的SB小鼠模型中对单个肿瘤细胞的转座子插入位点进行测序。研究人员对单个肿瘤的26个细胞进行SBCapSeq分析，结果显示了肿瘤的主要克隆亚群，可检测到其他方法检测不到的克隆插入事件，并可识别优势亚克隆。
研究者开发了一种转座子测序方法，以识别单个肿瘤细胞的SB转座子插入位点。这一新方法依赖于将肿瘤基因组DNA随机剪切为离散大小的DNA片段。离散大小的DNA片段不会发生PCR偏倚或测序错误。总而言之，研究者开发的生物信息学平台SBCapSeq可识别肿瘤块或单个肿瘤细胞的SB插入突变，以及确定肿瘤的异质性。（作者：贺利军)
参考文献：Nature Biotechnology 2016;34:962-972