特应性皮炎(atopic dermatitis，AD；湿疹)是工业化国家常见的炎症性皮肤病，影响10%至30%的儿童。AD患者具有慢性、复发性、瘙痒性和炎性的皮肤病损，并且发生哮喘或花粉症的可能性增加。AD是一种复杂的多因素疾病，其中表皮屏障损伤、2型免疫和皮肤微生物各自被认为可能起致病作用。

既往研究采用传统方法对培养菌株进行分型，或对细菌标志基因进行测序来研究AD患者的皮肤微生物群。宏基因组全测序分析提供了更大的分辨率，从而可从“界”到“种”(即界、门、纲、目、科、属、种)地阐明微生物群落，以及阐明菌株水平的多样性。美国国家卫生研究院的Byrd等人从儿科AD患者中取样，研究整个疾病过程中微生物的时间动态。

研究人员对AD发作患者进行“种”水平的研究，结果显示，在更严重疾病的患者中金黄色葡萄球菌占优势，在较轻的患者中，表皮葡萄球菌占优势。在菌株水平，宏基因组全测序分析在更严重的患者中证实存在金黄色葡萄球菌克隆株，在所有患者中证实存在异质的表皮葡萄球菌菌落。

为研究金黄色葡萄球菌的菌株水平的生物效应，研究人员将来自AD患者和对照的人类菌株局部定植至小鼠。该皮肤定植模型证实了金黄色葡萄球菌在引起AD患者皮肤炎症和免疫特征方面的菌株特异性差异。来自更严重发作的AD患者的金黄色葡萄球菌菌株诱导了表皮增厚和皮肤T辅助细胞2(T helper 2，TH2)和TH17细胞的扩增。总之，研究人员通过高分辨率测序、培养和动物模型证实，葡萄球菌菌株的功能差异可能导致AD疾病的复杂性。

该研究表明，在AD发作期间，患者皮肤可能具有更多的金黄色葡萄球菌，金黄色葡萄球菌可能导致了表皮增厚和免疫应答细胞的扩增。金黄色葡萄球菌可能与AD发作有关。(作者：黄希瑶)

参考文献：Sci Transl Med 2017;9:eaal4651