医学进展
2018年06月号
医学进展
现代观点

精神分裂症:TWAS助力GWAS机制理解

作者:钟芸

美国波士顿哈佛大学公共卫生学院流行病学系的Gusev等研究人员进行了一项大规模的精神分裂症相关的全转录组关联研究(transcriptome-wide association study,TWAS),鉴定出157个TWAS显著的基因,其中35个为新的基因位点,42个与特定染色质特征相关联。这一研究是理解精神分裂症与风险位点之间因果机制的重要一步。

全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)是指在全基因组层面上,开展多中心、大样本、反复验证的基因与疾病的关联研究,是通过对大规模的群体DNA样本进行全基因组高密度遗传标记(如SNP或CNV等)分型,从而寻找与复杂疾病相关的遗传因素的研究方法,全面揭示疾病发生、发展与治疗相关的遗传基因。

GWAS已经确定了100多个精神分裂症相关的风险位点,但其中的因果机制在很大程度上仍是未知的。研究人员由此进行了一项TWAS研究,该研究综合分析了来自于“精神病学基因组学联盟”(Psychiatric Genomics Consortium)的79845名精神分裂症个体的GWAS数据,以及3693名主要对照组个体的脑、血液和脂肪组织的表达数据。研究人员鉴定出了157个与精神分裂症密切相关的基因。其中35个基因未与已知的GWAS基因位点发生重叠。其中42个基因与在独立样本中检测到的特定染色质特征相关联。同时,在斑马鱼模型的研究中,研究人员发现将一种已鉴定出的易感基因mapk3抑制后,会对神经发育表型产生显著的影响。TWAS显著的基因在脑中表现出丰富的表达和剪接。

研究人员提出,组织采集可能是生成更大数据集的最大障碍。(作者:钟芸)

参考文献:Nature Genetics 2018;50:538-548

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