医学进展
2018年09月号
医学进展

新技术帮助精准定量肠道细菌

作者:贾盛崧

比利时鲁汶大学的Jeroen Raes教授等构建了一种基于扩增子测序和流式细胞计数的新型微生物定量方法。基于这种新的粪便微生物分析定量方法,研究者可以对不同人类个体的肠道菌群特征进行更为精准的描述。该研究成果发表于《自然》杂志。

尽管这些微生物组组成的相对比例可以检测疾病相关的微生物组的变化,但它们在揭示微生物群和宿主健康之间相互作用的能力是有限的。对微生物组成相对比例进行的比较分析不能提供有关菌群丰度或代谢变化的程度或方向的信息。显而易见,此类方法(微生物群组成谱分析)忽略了这样一种可能性,即微生物群整体丰度改变可能是引起疾病相关生态系统变化的关键因素。简而言之,目前大多数对于肠道微生物群结构的研究并不能体现出具体微生物数量改变给宿主带来的影响。

Raes教授等证实,使用扩增子测序和流式细胞仪计数,可量化分析肠道菌群;并通过绝对定量的方式,发现健康个体之间的肠道微生物负荷(即样品中的细菌数量)差异可高达10倍,且此差异与肠型(enterotype)分化有一定的相关性;也揭示了微生物丰度如何支持个体间的微生物群变异以及宿主表型的伴随改变。

此外,研究人员发现,一种低微生物负荷的肠型虽然在健康志愿者中少见,但它是克罗恩病患者最常见的微生物组结构。研究人员观察到,克罗恩病患者的粪便中所含的细菌比健康志愿者少50倍。这种惊人的细菌丰度的下降似乎是克罗恩病患者微生态失调的关键。研究人员想要进一步研究,是否这种低微生物细胞计数的肠型增加了患克罗恩病的风险。

对于试图将肠道细菌与健康和疾病等特定问题联系起来的研究人员和公司来说,测量和精确量化粪便样品中肠道细菌水平的新方法可能是一场革命。如果没有定量数据,百分比无法告诉你在特定疾病中,一种特定的细菌是否真的变多了。(作者:贾盛崧)

参考文献:Nature 2017;551:507-511

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