COVID-19 专题
2020年09月号
医学进展

COVID-19大流行对肿瘤生物样本库的影响

作者:贾盛崧

生物样本库可以确定其是否有适当的质量保证体系,且向最终用户证明该体系正在得到应用,并提供标准的安全保证。然而,这需要资金支持。当前疾病危机对于癌症研究所需的生物样本库是一个关键而紧迫的挑战。

Covid-19大流行突出了收集和处理尚不清楚SARS-CoV-2冠状病毒状态的人类生物样本的相关风险,无论这些样本是用于诊断、治疗还是研究等目的。在大流行期间继续收集并储存在生物样本库中的癌症患者的生物标本,很可能感染SARS-CoV-2。除尿液外,所有类型的生物样本(组织、生物流体和拭子)和器官均可能受影响。

SARS-CoV-2可能在加热到56℃(133℉)的福尔马林固定的石蜡包埋样本中失活。然而,由于SARS-CoV-2可以在各种不同的物质表面上存活,尚不清楚这是否也适用于含有福尔马林固定的石蜡样本包埋盒。由于SARS-CoV-2具有高度传染性,因此制备、储存、处理和运送人类样本至关重要,必须确保接触生物样本的人不仅熟悉安全处理潜在感染性液体或组织样本的程序,并且有能力自愿实施这些程序。

普遍预防仍然是控制人类样本潜在感染的最佳做法。因此,SARS-CoV-2阳性样本不应作相应标记,因为这些预防措施适用于所有生物样本(参考加利福尼亚大学旧金山分校的Covid-19生物样本指南)。必须在生物安全级别2级(BSL-2)下工作并使用II类生物安全工作台。生殖工作(如病毒培养、分离或中和试验)应在完全密闭的负压实验室(BSL-3)中进行。

然而,许多肿瘤生物样本库以及研究人员都无法使用上述安全设备。引进这些设备将是昂贵的,不仅是生物样本库,而且对需要这些样本及相关临床数据的学术界和生物技术/生物制药公司的研究人员也是如此。在当前Covid-19大流行期间和之后的时间里,应该在什么条件下从癌症患者身上收集生物材料?检测的相关伦理和法律后果也必须澄清。需要明确哪些Covid-19相关症状(如干咳或发热),以及由谁记录这些数据,直到什么时候。为了避免可能出现的交叉污染,立即适用的建议是将在Covid-19暴发期间收集的所有人类样本单独存储在生物样本库中。

生物样本库可以确定其是否有适当的质量保证体系,且向最终用户证明该体系正在得到应用,并提供标准的安全保证。质量保证体系还能够保证学术界和生物工业所要求的样本具有透明可追溯性。可追溯性可用来评估样本和相关数据的质量。然而,这需要资金支持。当前疾病危机对于癌症研究所需的生物样本库是一个关键而紧迫的挑战。(编译:贾盛崧)

参考文献:Nature Medicine 2020;26:809-810

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