医学进展
2019年12月号

从血液中寻找罕见病基因

作者:刘亚青

据估计,全世界有3.5亿人患有罕见病,这些疾病主要由单个基因的突变引起。目前的分子诊断率估计为50%,其中全外显子组测序(whole-exome sequencing,WES)是最成功的方法。对于WES无法提供信息的患者,RNA测序(RNA sequencing,RNA-seq)在特定组织和疾病中显示了诊断实用性。这包括来自未确诊的罕见肌肉疾病患者的肌肉活检以及来自线粒体疾病患者的成纤维细胞。然而,对许多人来说,活检组织很难获得。

来自斯坦福大学Stephen B. Montgomery的研究团队提出利用血液转录组测序和大规模对照队列来鉴定罕见病基因。研究发表在《自然·医学》杂志上。

研究团队从94名患有16种不同类型、未确诊罕见病的患者中提取了全血进行RNA-seq。他们开发了一种稳健的方法,将来自这些个体的数据与对照组(n=1594个无关对照组和n=49个家庭成员)的大量RNA序列数据进行比较。在整个队列中,研究人员观察到RNA-seq的诊断率为7.5%,在候选基因分辨率提高的情况下,其诊断率增加到了16.7%。

研究团队预期RNA-seq结合其他多个“组学”来源的信息,在未来会进一步提高对未解决的罕见病病例的诊断水平。(编译:刘亚青)

参考文献:Nature Medicine 2019;25:911-919

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