在学术界,有一种说法认为,RNA在生命进化早期起着非常关键的作用,存在一种RNA复制酶来复制自身RNA。然而这类复制酶是如何进化,并随后导致基因表达的,仍缺乏深入的研究。最近,加拿大西蒙弗雷泽大学分子生物学和生物化学教授Peter J. Unrau的团队分离出一种RNA聚合酶,这种酶基于启动子,能以RNA为模板合成RNA,为早期生命起源提供了新的见解。
Unrau等研究人员设计了一个使用sigma样特异性引物的全聚合酶。首先,通过sigma样特异性引物识别RNA启动子序列。然后,含有启动子的模板序列将特异性引物从RNA聚合酶结合位点剥离,从而触发结构重排成延伸形式。这种机制类似于细菌DNA依赖性RNA聚合酶(DNA-dependent RNA polymerases,DDRP)所使用的机制,DDRP通过两步过程识别启动子,包括sigma因子依赖性启动子识别和核苷三磷酸依赖性结构重排,最终形成延伸形式。利用自身序列,RNA聚合酶也可以从某些特定RNA启动子开始聚合。此外,这种聚合酶的钳样机制最终可能导致链侵入(strand invasion) ——即RNA侵入双链DNA,完成重组过程,这是生命早期进化中复制的关键条件。
该研究作者Unrau教授认为,“这种RNA聚合酶拥有现代蛋白质聚合酶的许多特征,它可以进化,从而识别出RNA启动子,然后复制RNA。我们的发现意味着,生命进化早期出现的同样的RNA酶,也可能表现出如此复杂的生物学特征。”
虽然在实验室中产生一个自进化系统仍然面临着许多突出挑战,包括提高聚合效率、保真度以及最重要的链侵入,但不可否认,启动子依赖性RNA聚合酶的开发,为人们深入了解地球生命在进化早期所面临的困境提供了新见解。
参考文献:Cojocaru R, Unrau PJ. Processive RNA polymerization and promoter recognition in an RNA World[J]. Science,2021,371:1225-1232.