类风湿关节炎（rheumatoid arthritis，RA）是一种病因未明的慢性、以滑膜炎为主的系统性自身免疫病。滑膜炎导致关节破坏，因此，寻找关键细胞亚群及其活化状态对研究RA非常重要。之前的研究发现：CD4+T细胞、B细胞、单核细胞和成纤维细胞与RA发病机制相关。

为确定RA中驱动关节炎症的关键细胞亚群，研究人员对51例RA或骨关节炎(OA)患者滑膜组织样本中的T细胞、B细胞、单核细胞和成纤维细胞进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术(RNA-seq)、RNA测序(RNA-seq)和流式细胞术，通过在单细胞层面对跨数据模态进行整合，以了解RA慢性炎症中特定的细胞亚群。

 研究招募了36名符合1987年美国风湿病学会(ACR)分类标准的RA患者和15名OA患者，从活检或关节置换中获得滑膜组织，通过对滑膜组织5265个细胞scRNA-seq谱的相关分析，研究人员共分类出18个细胞群。

 在成纤维细胞中，分类了四个亚群：CD34+亚细胞成纤维细胞，HLA-DRAhi成纤维细胞，DKK3+成纤维细胞和CD55+lining成纤维细胞。在单核细胞中, 研究人员分类了IL1B+促炎单核细胞，NUPR1+单核细胞，C1QA+单核细胞和干扰素（IFN）活化的单核细胞；在T细胞中，分类了3个CD4+群和3个CD8+群。在B细胞内，分类了四个细胞群。

 研究人员还定义了以GZMK+、GZMB+和GNLY+型为特征的CD8+T细胞的不同亚群，并将炎症介质归因到它们的源细胞群。例如，研究人员将IL6的表达归因于THY1+HLA-DRAhi成纤维细胞，把IL1B的产生归因于促炎单核细胞。（编译：宫健)

参考文献：Nature Immunology 2019;20:928-942